建國后建立大垟行政村，隸屬于黃源鄉(xiāng)；1958年公社化時稱大垟生產(chǎn)隊，隸屬于和平管理區(qū)；1961年體制下放建大垟大隊，隸屬于和平公社；1981年和平公社改稱黃源公社，隸屬于黃源公社；1984政社分設(shè)改設(shè)大垟村村民委員會，隸屬于黃源鄉(xiāng)；2011年9月黃源鄉(xiāng)并入崇頭鎮(zhèn)，隸屬于崇頭鎮(zhèn)。
2019年5月，根據(jù)《云和縣人民政府關(guān)于同意崇頭鎮(zhèn)部分行政村規(guī)模調(diào)整的批復(fù)》（云政函〔2019〕31號），同意合并大垟村、貴莊村、盤條口村、坑下村等4個村民委員會，建立大垟村村民委員會，隸屬于崇頭鎮(zhèn)。
名稱至今沿用。