雅礱悉補(bǔ)野第七代贊普止貢贊布被洛昂殺害后，其一子夏遲逃至工布建“工域赤那”，統(tǒng)治工布地區(qū)。
后稱為“貢杰噶布”（即工布王）。
7世紀(jì)中葉，吐蕃贊普松贊干布征服工域赤那。
將工布一帶劃入約茹轄區(qū)。
8世紀(jì)末與9世初，吐蕃贊普赤松德贊和赤德松贊分別兩次與工布王立誓結(jié)盟，承諾和確認(rèn)工布王世代享有治理工布地區(qū)的特權(quán)。
唐咸通十年（869，藏歷土牛年），欽域那布古蘇（今朗縣一帶）爆發(fā)奴隸平民起義。
起義軍攻下工域赤那（今巴宜區(qū)林芝鎮(zhèn)），推翻了工布王的統(tǒng)治。
工布地方陷入分裂割據(jù)局面。
11世紀(jì)，工布王的后裔阿杰在工布恰納一帶崛起，重新成為工布地區(qū)的統(tǒng)治者。
元朝及薩迦政權(quán)時(shí)期，今林芝地方隸屬烏思藏宣慰使司都元帥府管轄。
明代帕木竹巴政權(quán)時(shí)期，今巴宜區(qū)境大部分地區(qū)屬于烏思藏行都指揮使管轄。
14世紀(jì)，噶瑪嘎舉派的首領(lǐng)噶瑪巴長期駐錫工布則拉崗，逐漸成為工布地區(qū)最具有勢(shì)力的政教統(tǒng)治者。
明崇禎十五年（1642，藏歷第十一饒迥水馬年），噶丹頗章政權(quán)建立后，工布噶瑪噶舉派的勢(shì)力不承認(rèn)其統(tǒng)治地位，并組織軍隊(duì)對(duì)抗。
噶丹頗章政權(quán)沒有將其設(shè)于其統(tǒng)治之下。
清康熙二年（1663，藏歷第十一饒迥水兔年），噶丹頗章政權(quán)平定盤德寺暴亂后，始設(shè)則拉崗宗。
康熙十二年（1673，藏歷第十一饒迥水牛年），清廷調(diào)解了工布噶瑪噶舉派與噶丹頗章政權(quán)的對(duì)抗。
噶丹頗章政權(quán)在林芝境內(nèi)設(shè)則拉崗宗、角木宗。
則拉崗宗為大宗。
1931年（藏歷第十六饒迥鐵羊年），西藏地方政府平息波密之亂后設(shè)立工基。
則拉崗宗、角木宗歸工基管轄。
1939年（藏歷第十六饒迥土兔年），西康省設(shè)立，將林芝地方劃入西康省。
1959年3月，國務(wù)院發(fā)布命令，成立林芝縣軍事管制委員會(huì)并開展工作。
1959年9月，林芝縣正式成立。
1960年2月，塔工專區(qū)改為林芝專區(qū)，林芝縣直屬林芝專區(qū)。
1964年6月，林芝專區(qū)撤銷，林芝縣劃歸拉薩市。
1986年2月，林芝地區(qū)恢復(fù)成立，林芝縣復(fù)歸林芝地區(qū)。
2015年3月，撤銷林芝縣，設(shè)立縣級(jí)巴宜區(qū)。
2015年3月，撤銷林芝地區(qū)，設(shè)立地級(jí)林芝市，巴宜區(qū)隸屬林芝市。