解放前屬太平鄉(xiāng)六保，一部分解放后為六農會，由興隆、雙院兩村和矛氏村的一半組成，至高級社時，統(tǒng)稱雙院村。
1959年稱雙院管區(qū)。
1962年從郊區(qū)（沿灘區(qū)）舒坪公社劃出高峰、龍神、考舉、河山、羅沖、肖家、雙院7個管區(qū)組建高峰公社，雙院大隊是7個大隊之一。
1966年曾更為“反演變”大隊，大隊群眾習慣使用而自行廢除。
1983年撤隊稱村，雙院大隊更名為雙院村。
2005年8月1日隨高峰鄉(xiāng)劃歸自流井區(qū)，2020年5月11日將肖廟村合并到雙院村，屬高峰街道管轄至今。