飛龍觀街市形成于清雍正年間，清康熙年間，境域?qū)俸楹相l(xiāng)上南路，清康熙二年（1663年），屬洪合鄉(xiāng)上南路。
清嘉慶年間，屬飛龍團。
清乾隆二十二年（1757）頒布保甲法，境域內(nèi)為飛龍觀保和興隆場保。
清乾隆二十三年（1758年），屬飛龍觀保。
清嘉慶后，又改為團，分別為飛龍團和興隆團。
民國二十三年（1934），將飛龍團、興隆團、郅安團合并為飛龍鎮(zhèn)，次年隸屬第3區(qū)。
鎮(zhèn)鄉(xiāng)正式成為一級基層行政機關(guān)。
民國二十九年（1940年），改鄉(xiāng)公所。
1950年，行政區(qū)劃作重大調(diào)整，境域設(shè)有飛龍、興隆、安隆鄉(xiāng)，均屬12區(qū)管轄。
1955年12月，三鄉(xiāng)部分合并為飛龍鄉(xiāng)。
1958年政社合一，并調(diào)整區(qū)劃，興隆、安隆鄉(xiāng)分別劃給趙化公社和飛龍公社。
1961年，又分設(shè)興隆公社。
1981年，興隆公社更名新農(nóng)公社。
1983年底，為新農(nóng)鄉(xiāng)。
1984年，改公社為鄉(xiāng)，境域有飛龍鄉(xiāng)和新農(nóng)鄉(xiāng)。
2001年4月，撤區(qū)并鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，飛龍鄉(xiāng)與新農(nóng)鄉(xiāng)合并建飛龍鎮(zhèn)，直屬富順縣。