1951年，屬巴中縣萬安鄉(xiāng)管轄。
1958年，設(shè)立萬安管理區(qū)，又稱第二管區(qū)。
1962年，更名為萬林生產(chǎn)大隊(duì)，簡稱萬林大隊(duì)，又稱二大隊(duì)。
1969年，更名為萬林大隊(duì)革命委員會。
1981年，復(fù)名萬林生產(chǎn)大隊(duì)。
1984年，全國實(shí)行政社分設(shè)，撤銷萬林生產(chǎn)大隊(duì)，設(shè)立萬林村村民委員會，簡稱萬林村村委會。
1993年以前歸達(dá)縣地區(qū)巴中縣管轄，1993年7月5日，國務(wù)院批準(zhǔn)將達(dá)縣地區(qū)更名為達(dá)川地區(qū)，設(shè)立巴中地區(qū)，撤銷巴中縣，歸巴中市管轄。
2000年6月14日，國務(wù)院批準(zhǔn)，撤銷巴中地區(qū)和縣級巴中市，設(shè)立地級巴中市，歸巴州區(qū)管轄，2013年1月18日，經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)，同意將巴州區(qū)一分為二，設(shè)立恩陽區(qū)，歸恩陽區(qū)管轄。
2020年，村級建制調(diào)整，將檬埡村、萬林村合并，設(shè)萬林村。