1958年8月,第三次區(qū)劃調(diào)整,撤銷杜寨鄉(xiāng),設(shè)立楊陵鄉(xiāng)。
崔東溝、馬家底、元樹、崔西溝4個自然村組建元樹生產(chǎn)大隊,隸屬于楊陵鄉(xiāng);10月,隸屬于楊陵(紅旗)人民公社;12月,武功縣并入興平縣,元樹生產(chǎn)大隊隸屬于興平縣楊陵人民公社。
1959年3月,興平縣楊陵人民公社下設(shè)楊村等4個管理區(qū),元樹生產(chǎn)大隊隸屬于楊村管理區(qū)。
1961年9月,第四次區(qū)劃調(diào)整,復(fù)設(shè)武功縣,武功縣撤銷楊村管理區(qū),設(shè)立武功縣楊陵人民公社,元樹生產(chǎn)大隊隸屬于武功縣楊陵人民公社。
1982年2月,陜西省設(shè)立寶雞市楊陵區(qū),元樹生產(chǎn)大隊隸屬于寶雞市楊陵區(qū)楊陵人民公社。
1983年10月,楊陵區(qū)劃歸咸陽市管轄,元樹生產(chǎn)大隊隸屬于咸陽市楊陵區(qū)楊陵人民公社。
1984年3月,國家行政區(qū)劃體制改革,人民公社稱謂改“鄉(xiāng)”,生產(chǎn)大隊稱謂改“村”。
楊陵區(qū)撤銷楊陵人民公社,設(shè)立楊村鄉(xiāng),元樹生產(chǎn)大隊析為崔東溝、馬家底、元樹、崔西溝4個行政村,崔東溝村、馬家底村隸屬于楊村鄉(xiāng)。
2011年6月,楊陵區(qū)撤銷楊村鄉(xiāng),崔東溝村、馬家底村隸屬于楊陵街道。
2015年3月,楊陵區(qū)鎮(zhèn)村行政區(qū)劃調(diào)整,崔東溝村、馬家底村合并為崔東溝村,隸屬于楊陵街道。