漢時(shí)為潼亭。
民國(guó)三十三年(1944年)前,各村莊分屬潼關(guān)、華陰、閿鄉(xiāng)3縣,政區(qū)無考。
同年,轄區(qū)有南劉、蘇家、南街、凹里、十里鋪、西北等屬城關(guān)鎮(zhèn);西廒、金盆屬桃林鄉(xiāng);寺角營(yíng)、荒移、楊家莊屬漢城鄉(xiāng);新城堡、四知、公莊、小泉屬四知鄉(xiāng)。
1951年,蘇家、南劉、南街、十里鋪、西北屬第一區(qū),公莊、四知、桃林寨、新城堡、小泉屬第二區(qū),金盆、西廒屬第三區(qū),寺角營(yíng)、荒移、楊家莊屬第四區(qū)。
1955年,撤區(qū)并鄉(xiāng)后,各村分屬城關(guān)鎮(zhèn)、吊橋鄉(xiāng)、十里鋪鄉(xiāng)。
1961年,恢復(fù)潼關(guān)縣建制后,設(shè)港口公社,轄1個(gè)社區(qū)和11個(gè)生產(chǎn)隊(duì)。
1984年,改為港口鎮(zhèn)。
1994年8月,從港口鎮(zhèn)中分出凹里、十里鋪、西北,設(shè)橋頭鎮(zhèn)。
1995年7月,更名為秦東鎮(zhèn)。
2002年1月,港口鎮(zhèn)、秦東鎮(zhèn)合并為秦東鎮(zhèn),人民政府駐原港口鎮(zhèn)。
2010年8月,將高橋鄉(xiāng)的新城堡、四知(吊橋)、公莊、桃林寨、小泉5個(gè)行政村劃歸秦東鎮(zhèn)。