宋代時期，境域屬蓬萊縣沙門寨地。
元、明時，屬蓬萊縣牽牛社。
清道光年間，長山諸島劃為13社，境域為砣磯島社；清宣統(tǒng)時，社內轄大口、后口、磨石嘴、井口、呂山口5村。
民國十七年（1928年），為長山八島民政局所轄，仍名駝磯社。
民國二十三年（1934年），社改鄉(xiāng)。
民國三十四年（1945年），設砣磯區(qū)，屬長山島特區(qū)。
民國三十六年（1947年），改設駝磯鄉(xiāng)。
1949年后，仍為砣磯鄉(xiāng)。
1958年11月，長島縣并入蓬萊縣，為長島公社砣磯大隊。
1963年6月，復置長島縣，改設駝磯公社。
1984年，撤公社設砣磯鎮(zhèn)。
2000年12月，撤鎮(zhèn)改設砣磯區(qū)公所。
2003年2月，改設砣磯鎮(zhèn)。