1933年7月偽滿時期隸屬代銅區(qū)范圍。
1939年把區(qū)、鎮(zhèn)改為村、屯，當時寶日勿蘇屬于翁根村。
1948年寶日勿蘇被劃分在翁根努圖克。
1957年5月更名改建為寶日勿蘇蘇木。
1958年11月設寶日勿蘇人民公社。
1961年原寶日勿蘇人民公社劃分為寶日勿蘇人民公社與巴彥查干人民公社。
1984年春改建為寶日勿蘇蘇木。
1988年8月30日根據(jù)內蒙古自治區(qū)民政（1988）第74號文件批復，改設為寶日勿蘇鎮(zhèn)。
2001年6月與洪格爾蘇木（1984年將巴彥查干公社更名為洪格爾蘇木）合并建立寶日勿蘇鎮(zhèn)，政府駐地設在寶日勿蘇嘎查，沿用至今。