據(jù)《光緒湖北與地記》卷18載：清光緒二十年（1894）鐘祥縣設(shè)5鎮(zhèn)，4汎，5鄉(xiāng)，客店屬于東北鄉(xiāng)。
1936年10月，縣設(shè)5區(qū)，50鄉(xiāng)（鎮(zhèn)），現(xiàn)客店轄區(qū)含為芹平鄉(xiāng)，屬第一區(qū)，長吉鄉(xiāng)屬第五區(qū)。
1941年實行新縣制，廢區(qū)。
全縣設(shè)31鄉(xiāng)（鎮(zhèn)），芹平鄉(xiāng)和長吉鄉(xiāng)合并為長吉鄉(xiāng)。
1946年長吉鄉(xiāng)更名為臨九鄉(xiāng)。
1947年12月，鐘祥城北地區(qū)解放，成立鐘北縣愛國民生政府。
現(xiàn)客店鎮(zhèn)區(qū)域含兩個地區(qū)；1948年4月，周集區(qū)轄表臺，劉河，周集三個鄉(xiāng)；客店坡轄公議，草店，客店，大河，嶺臺，民主六個鄉(xiāng)。
1948年6月鐘北縣撤銷并入洪山縣。
1949年7月，鐘祥，京山縣成立人民政府，周集，客店坡劃歸鐘祥，所轄九個鄉(xiāng)名未變。
1951年1月，客店坡更名為鐘祥市第十鎮(zhèn)。
1956年二月，第十鎮(zhèn)改名為農(nóng)場工業(yè)指導(dǎo)組，1957年12月，指導(dǎo)組撤銷，社客店鎮(zhèn)；1958年9月人民公社化，客店鎮(zhèn)改名為客店人民公社，下設(shè)三個鄉(xiāng)改為三個管理組。
1961年恢復(fù)鎮(zhèn)制，客店人民公社復(fù)名為客店區(qū)，下轄三個管理組改設(shè)為三個人民公社，1975年11月25日撤區(qū)并社，客店區(qū)改為客店人民公社，1984年撤銷人民公社，設(shè)立客店區(qū)，1987年撤區(qū)建鄉(xiāng)，客店區(qū)改名為客店鄉(xiāng)，1992年3月更名為客店鎮(zhèn)。