清同治屬周陂鄉(xiāng)，抗戰(zhàn)勝利后屬第四區(qū)（亦稱韓集區(qū)），解放初屬韓集區(qū)。
1956年為馬港、毫口合作社，屬垌塚區(qū)。
1958年為聯(lián)盟、毫口兩個(gè)大隊(duì)，屬垌塚公社。
1961年聯(lián)盟為馬港大隊(duì)，屬垌塚區(qū)韓集公社；1966年馬港、豪口合并名紅旗四隊(duì)。
1968年為馬港大隊(duì)，1974年分開為紅纓大隊(duì)、馬港大隊(duì)。
1976年又合并紅纓大隊(duì)，屬韓集公社；1981年更名為馬港大隊(duì)，1984年更名為馬港村村民委員會(huì)，屬新堰區(qū)韓集鄉(xiāng)，1989年韓集鄉(xiāng)。
2021年馬港村、河口村合并為南支村。