原秦灣村：明嘉靖年間屬惠化鄉(xiāng)；清康熙年間屬從義鄉(xiāng)；民國時(shí)期屬青吉鄉(xiāng)；1949年5月屬陳巷區(qū)；1956年為秦灣社，屬陳巷區(qū)西草店鄉(xiāng)；1958年成立人民公社，更名為秦灣大隊(duì)，屬紅旗公社西草店管理區(qū)；1959年為秦灣大隊(duì)，屬陳巷公社西草店管理區(qū)；1961年4月恢復(fù)區(qū)（鎮(zhèn)）建制，為秦灣大隊(duì)，屬陳巷區(qū)西草店公社；1975年2月撤區(qū)并社，為秦灣大隊(duì)，屬陳巷公社；1977年撤聯(lián)興公社并入駱店公社，為秦灣大隊(duì)，屬駱店公社；1979年2月撤駱店公社并入陳巷公社，為秦灣大隊(duì)，屬陳巷公社西草店管理區(qū)；1983年底設(shè)區(qū)建鄉(xiāng)，為秦灣村，屬陳巷區(qū)草店鄉(xiāng)；1987年9月撤區(qū)并鄉(xiāng)，為秦灣村，屬駱店鄉(xiāng)。
原花墳村：明嘉靖年間屬惠化鄉(xiāng)；清康熙年間屬從義鄉(xiāng)；民國時(shí)期屬青吉鄉(xiāng)；1949年5月屬陳巷區(qū)；1955年為花墳社，屬陳巷區(qū)西草店鄉(xiāng)；1958年成立人民公社，為花墳大隊(duì)，屬紅旗公社西草店管理區(qū)；1959年為花墳大隊(duì)，屬陳巷公社西草店管理區(qū)；1961年4月恢復(fù)區(qū)（鎮(zhèn)）建制，為花墳大隊(duì)，屬陳巷區(qū)西草店公社；1975年2月撤區(qū)并社，為花墳大隊(duì)，屬陳巷公社；1977年撤聯(lián)興公社并入駱店公社，為花墳大隊(duì)，屬駱店公社；1979年2月，撤駱店公社并入陳巷公社，為秦灣大隊(duì)，屬陳巷公社西草店管理區(qū)；1983年底設(shè)區(qū)建鄉(xiāng)，為花墳村，屬陳巷區(qū)草店鄉(xiāng)；1987年9月撤區(qū)并鄉(xiāng)，為花墳村，屬駱店鄉(xiāng)。
2004年撤村并村，秦灣村和花墳村合并為靈山村，屬駱店鄉(xiāng)；2014年8月撤駱店鄉(xiāng)設(shè)駱店鎮(zhèn)，為靈山村，屬駱店鎮(zhèn)至今。