清道光十六年（1836）稱“達乎爾店”，曾譯寫作“達胡爾店”“達胡店＂“達呼里店”，后改稱今名，隸屬齊齊哈爾副都統(tǒng)管轄。
清末，達呼店一帶，先后隸屬黑水廳、龍江府管轄。
中華民國時期，隸屬龍江縣第三區(qū)管轄。
東北淪陷后，初為達胡店鄉(xiāng)保，后改設達胡店村。
1945年“九三”戰(zhàn)爭勝利后，1946年6月設置達胡店區(qū)，后改為第八區(qū)。
1954年10月，劃歸齊齊哈爾市，設置達呼店區(qū)。
1956年5月，并村劃鄉(xiāng)，設置達呼店鄉(xiāng)。
1958年12月，并人雅爾塞農場，1966年改為雅爾塞人民公社。
1978年從雅爾塞公社劃出，設置達呼店公社。
1984年1月，改為達呼店鄉(xiāng)。
1990年12月，改設達呼店鎮(zhèn)。