1921年屬鶴齡鄉(xiāng)。
1927年屬思南縣合朋復興區(qū)署。
1952年屬長壩鄉(xiāng)。
1958年公社時代，取名碑記坳大隊，屬長壩公社管轄。
1984年撤大隊設碑記坳村，屬合朋溪區(qū)的長壩鄉(xiāng)管轄。
1992年2月，貴州省人民政府批準思南縣進行“建鎮(zhèn)并鄉(xiāng)撤區(qū)”工作，同年10月，撤銷長壩鄉(xiāng)、坡頂苗族土家族鄉(xiāng)、水塘鄉(xiāng)合并建立長壩苗族土家族鄉(xiāng)，轄原三個鄉(xiāng)鎮(zhèn)的共15個行政村，碑記坳村屬長壩苗族土家族鄉(xiāng)管轄。
2007年4月，縣人民政府下達《關于撤小村并大村整合的批復》，全縣開展撤小村并大村工作，把全縣561個村合并成168個村，長壩苗族土家族鄉(xiāng)將原15個村合并為4個村，其中，碑記坳村由碑記坳村、佘溪村、丁家山村、謝窩溝村合并而成。
2010年11月16日，思南縣人民政府批準調整全縣行政區(qū)劃，同意思唐鎮(zhèn)等27個鄉(xiāng)鎮(zhèn)行政村（社區(qū)）調整設置為行政村489個，社區(qū)37個。
長壩苗族土家族鄉(xiāng)調整設置為14個行政村，1個社區(qū)，碑記坳村屬長壩苗族土家族鄉(xiāng)管轄。