東源縣地域?yàn)樵釉纯h主體。
南朝齊永明元年(483)從龍川析置河源,屬南海郡。
唐肅宗乾元元年(758)屬循州。
宋太祖開寶四年(971),屬禎州。
明太祖洪武元年(1368),屬惠州府。
清屬惠州府。
1925年屬東江行政區(qū)。
1949年屬東江專區(qū)。
1953年屬粵東行政區(qū)。
1956年屬惠陽專區(qū)。
1959年屬韶關(guān)專區(qū)。
1963年至1987年屬惠陽地區(qū)。
1988年1月,經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn),撤銷河源縣,設(shè)立河源市,原河源縣分設(shè)河源市源城區(qū)和河源市郊區(qū)。
1993年11月8日,撤銷河源市郊區(qū),設(shè)立東源縣。