鎮(zhèn)域北宋時已有人定居，古時是南洋村的一部分。
澄海置縣前，先后屬揭陽縣、海陽縣、饒平縣置縣后，明清時期屬縣的蘇灣都。
民國時期先后屬蘇南區(qū)、第二區(qū)，也曾分屬蓮中鄉(xiāng)和蓮北鄉(xiāng)。
1949年10月5日，澄海解放，蓮上歸屬蘇南區(qū)。
1953年，歸屬第二區(qū)。
1956年，分屬蓮陽上鄉(xiāng)和蓮陽下鄉(xiāng)。
1957年，歸屬蘇南鄉(xiāng)。
1958年9月15日，屬澄海縣公社第--支隊，蘇南公社。
1968年，屬東方紅公社。
1972年12月26日，從東方紅公社中劃出，設蓮上公社。
1984年1月，全縣實行“政社分開"，蓮上公社改設為澄�？h蓮上區(qū)。
1987年1月，撤區(qū)建鎮(zhèn)，蓮上區(qū)改設為蓮上鎮(zhèn)至今。
1994年，澄�？h撤縣建市，蓮上鎮(zhèn)隸屬澄海市。
2003年5月，澄海市改設為汕頭市澄海區(qū)，蓮上鎮(zhèn)隸屬澄海區(qū)。