其前身為楊家堡村和水庫村。
楊家堡村1950年建政，屬四區(qū)五鄉(xiāng)三行政。
1955年建紅光初級(jí)社。
1956年并入水庫高級(jí)社。
1958年為敦煌人民公社河西大隊(duì)水庫生產(chǎn)隊(duì)。
1961年建楊家堡大隊(duì)。
1966年更名為紅衛(wèi)公社立新大隊(duì)。
1969年恢復(fù)原名。
1983年3月改置村。
水庫村有3個(gè)村民小組。
清雍正年間，水庫村從甘肅省河州（清代河州屬蘭州府，與當(dāng)時(shí)的狄道州并列。
河州當(dāng)時(shí)的管轄范圍為現(xiàn)在我省的東鄉(xiāng)撤拉族回族自治縣、和政縣、夏河縣、臨夏市、永靖縣及青海省的循化撒拉族自治縣。
（注：河州存在時(shí)，上述地方并沒設(shè)縣治）遷入移民，建新河州坊。
孟家橋鄉(xiāng)與肅州鎮(zhèn)接壤處曾有一湖，地處戈壁，四面環(huán)沙，為地下泉水匯集而成。
雖湖面寬廣，于民溉田水量卻很有限。
1949年后，縣上組織人員在湖內(nèi)修建兩座水壩，積蓄湖水灌溉笆子場(chǎng)以及下游的大片良田，一個(gè)簡(jiǎn)易的蓄水庫就這樣形成了。
雖然水量不大，但它是敦煌縣修建最早的蓄水庫，后來，人們稱此地為水庫村。
水庫村1950年建政時(shí)為四區(qū)五鄉(xiāng)四行政。
1955年和11、12、13行政村組成水庫初級(jí)社。
1957年和楊家堡并為高級(jí)五社。
1958年為敦煌人民公社河西大隊(duì)第八中隊(duì)。
1961年建水庫大隊(duì)。
1983年3月改置村。
2007年1月省入楊家堡村。