1934年屬第一區(qū)（城關(guān)）。
1937年為圣安、進(jìn)賢鄉(xiāng)的一部分。
1950年10月，屬第一區(qū)。
1956年8月，屬城關(guān)區(qū)。
1957年6月，屬東坑郊區(qū)。
1958年11月，屬東坑紅旗人民公社。
次年，屬東坑公社。
1961年7月，屬延平公社和東坑公社。
1982年，設(shè)水南街道，屬南平市人民政府城市工作辦公室。
1991年6月，撤銷城市工作辦公室，屬縣級(jí)南平市人民政府。
1992年11月，撤銷東坑鄉(xiāng)，東坑、尤坑、八仙、上地、玉地、嶺炳洋和羅源7個(gè)村劃歸街道管轄。
1995年1月，撤市設(shè)區(qū)，屬南平市延平區(qū)。
1999年，撤銷林鋼、尤坑、沙門、后甲、鯉魚洲5個(gè)社區(qū)。
2001年11月，水南鐵路社區(qū)改為水南社區(qū)，撤銷嶺下橋社區(qū)，成立九峰社區(qū)。
2015年撤銷院口社區(qū)，新成立了江南社區(qū)和世華社區(qū)。
2017年8月撤際頭場(chǎng)成立際源村。