南齊時設東陽郡。
清代為巴縣之白碚鎮(zhèn)。
1936年，設嘉陵江三峽鄉(xiāng)村建設實驗區(qū)，為一等縣地方行政機構(gòu)，區(qū)署駐北碚場。
1942年，實驗區(qū)改為北碚管理局，按一等縣設置機構(gòu)和行使地方權(quán)力。
同時改北碚場為朝陽鎮(zhèn)。
1949年12月，北碚解放，劃歸重慶市管轄，改稱北碚行政管理處。
1951年12月，劃歸川東行政區(qū)管轄，建北碚市，為川東人民行政公署首府。
1953年10月，川東行政區(qū)撤銷，改北碚市為重慶市第六區(qū)。
1955年3月，復改為重慶市北碚區(qū)。
1997年，設重慶直轄市，北碚區(qū)隸屬之。