先秦時期，分屬胡子國、州來國地、后屬楚地；秦，分屬汝陰、下蔡縣地；漢，析置城父、山�？h；南北朝時期，南宋將城父縣并入浚儀、北魏于山�？h地置渦陽縣；隋，復置城父、山�？h；唐天寶元年（742）改山�？h為蒙城縣；明洪武中，城父縣入亳州，下蔡縣入壽州；清雍正十一年（1733），置鳳臺縣。
雍正十三年（1735），置阜陽縣。
同治三年（1864），置渦陽縣；民國，依清制；1964年10月31日，從阜陽、渦陽、蒙城、鳳臺四縣劃出部分地區(qū)設(shè)置利辛縣。
1965年5月1日，組建利辛縣人民委員會，析阜陽縣王人、王市、馬店、胡集4區(qū)，析渦陽縣閻集、江集、張村3區(qū)，析鳳臺縣闞疃、展溝2區(qū)，析蒙城縣望疃區(qū)，共10個區(qū)組成利辛縣轄區(qū)。
1969年撤銷10個區(qū)和54個公社，設(shè)20個大公社。
1975年設(shè)區(qū)劃社，置12個區(qū)、51個公社。
1981年成立利辛縣人民政府。
1983年政社分開，恢復鄉(xiāng)、村建制，58個公社全部改稱鄉(xiāng)，設(shè)立鄉(xiāng)人民政府。
1985年廢柳東鄉(xiāng)，置張村鎮(zhèn)，隸屬張村區(qū)，廢闞疃鄉(xiāng)，置闞疃鎮(zhèn)，隸屬闞疃區(qū)，廢西潘樓鄉(xiāng)，置西潘樓鎮(zhèn)，隸屬西潘樓區(qū)。
1992年撤區(qū)并鄉(xiāng)，轄19鎮(zhèn)、7鄉(xiāng)。
2000年，成立亳州地級市，利辛劃歸亳州市管轄。
至2020年，利辛縣下轄20個鎮(zhèn)、3個鄉(xiāng)。